前作『パチスロマクロスフロンティア2』のゲーム性を踏襲しているが、システムは純粋なボーナスとARTでコインを増やすタイプに変更されている。

そのボーナスは4種類。究極クランボーナスは純増204枚＋ART突入確定。アルトボーナスは純増204枚。シェリルボーナスとランカボーナスは純増120枚。いずれもボーナス中にARTを抽選する。なお、ARTは通常時からも突入する可能性あり。メドレーステップアップやチャンスゾーン「バジュラアタック」「デカルチャンス」に期待しよう。

ART「バルキリータイム」は、1Gあたり約1.5枚の純増で、開始時に発生するトライアングルチャンスによって初期ゲーム数が決まる。選択されるキャラクターによって内容と期待度は変化するが、最低でも40G以上が保証される。

ART中は、チャージポイントがMAXの8ptに到達すると乗せ抽選ゾーン「フォールドチャンス」に突入。最終ゲームで告知が発生すれば「マクロスクォーターアタック」に発展。ゲーム数上乗せ or 上乗せ特化ゾーン突入のチャンスとなる。